MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS3

Total Repeats: 1821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016839	TTG	2	6	149	154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975833
2	NC_016839	AATA	2	8	160	167	75 %	25 %	0 %	0 %	378975833
3	NC_016839	GTG	2	6	197	202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975833
4	NC_016839	T	7	7	310	316	0 %	100 %	0 %	0 %	378975834
5	NC_016839	A	6	6	319	324	100 %	0 %	0 %	0 %	378975834
6	NC_016839	CAA	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975834
7	NC_016839	ACG	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975834
8	NC_016839	GATC	2	8	432	439	25 %	25 %	25 %	25 %	378975834
9	NC_016839	TCC	2	6	449	454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975834
10	NC_016839	GAT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975834
11	NC_016839	AACG	2	8	474	481	50 %	0 %	25 %	25 %	378975834
12	NC_016839	ACC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975834
13	NC_016839	ACTC	2	8	542	549	25 %	25 %	0 %	50 %	378975834
14	NC_016839	TGCCAA	2	12	584	595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378975834
15	NC_016839	ATCC	2	8	666	673	25 %	25 %	0 %	50 %	378975834
16	NC_016839	A	7	7	730	736	100 %	0 %	0 %	0 %	378975834
17	NC_016839	ATCA	2	8	766	773	50 %	25 %	0 %	25 %	378975835
18	NC_016839	CCA	2	6	801	806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975835
19	NC_016839	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975835
20	NC_016839	CAG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975835
21	NC_016839	T	8	8	937	944	0 %	100 %	0 %	0 %	378975835
22	NC_016839	AGT	2	6	1006	1011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975835
23	NC_016839	ACG	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975835
24	NC_016839	CCT	3	9	1132	1140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975835
25	NC_016839	GAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975835
26	NC_016839	TCT	2	6	1196	1201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975835
27	NC_016839	TCC	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975835
28	NC_016839	TGA	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975835
29	NC_016839	TCT	2	6	1282	1287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975835
30	NC_016839	TTA	2	6	1308	1313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975835
31	NC_016839	TGA	2	6	1346	1351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975835
32	NC_016839	CAC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975835
33	NC_016839	GCA	2	6	1432	1437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975835
34	NC_016839	GCC	2	6	1511	1516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975835
35	NC_016839	TTC	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975835
36	NC_016839	GAC	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975835
37	NC_016839	CAT	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975835
38	NC_016839	CCA	2	6	1669	1674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975835
39	NC_016839	GCA	2	6	1686	1691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975835
40	NC_016839	ATG	2	6	1722	1727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975835
41	NC_016839	CGGAG	2	10	1754	1763	20 %	0 %	60 %	20 %	378975835
42	NC_016839	GTT	2	6	1770	1775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975835
43	NC_016839	ACC	2	6	1836	1841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975835
44	NC_016839	GCT	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975836
45	NC_016839	ATC	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975836
46	NC_016839	AAG	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975836
47	NC_016839	TGG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975836
48	NC_016839	ATCC	2	8	2243	2250	25 %	25 %	0 %	50 %	378975837
49	NC_016839	CAT	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975837
50	NC_016839	TGG	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975837
51	NC_016839	GAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975837
52	NC_016839	TGG	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975837
53	NC_016839	ACA	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975837
54	NC_016839	CAT	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975837
55	NC_016839	GTCAT	2	10	2858	2867	20 %	40 %	20 %	20 %	378975838
56	NC_016839	GCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975838
57	NC_016839	TTGG	2	8	3052	3059	0 %	50 %	50 %	0 %	378975838
58	NC_016839	TCA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975838
59	NC_016839	GAC	2	6	3198	3203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975838
60	NC_016839	TCT	2	6	3218	3223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975838
61	NC_016839	ATC	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975838
62	NC_016839	ATC	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975839
63	NC_016839	GTG	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975839
64	NC_016839	CA	3	6	3461	3466	50 %	0 %	0 %	50 %	378975839
65	NC_016839	ACCAA	2	10	3502	3511	60 %	0 %	0 %	40 %	378975839
66	NC_016839	CA	3	6	3610	3615	50 %	0 %	0 %	50 %	378975839
67	NC_016839	GTT	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975839
68	NC_016839	AAG	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975839
69	NC_016839	ATCC	2	8	3749	3756	25 %	25 %	0 %	50 %	378975839
70	NC_016839	CCT	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975839
71	NC_016839	GCC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975840
72	NC_016839	TGG	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975840
73	NC_016839	CAA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975840
74	NC_016839	CCA	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975840
75	NC_016839	GGC	2	6	4307	4312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975840
76	NC_016839	GCA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975841
77	NC_016839	AAG	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975841
78	NC_016839	TTC	2	6	4474	4479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378975841
79	NC_016839	TTCCC	2	10	4501	4510	0 %	40 %	0 %	60 %	378975841
80	NC_016839	TGGC	2	8	4517	4524	0 %	25 %	50 %	25 %	378975841
81	NC_016839	TGC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975841
82	NC_016839	ATG	2	6	4549	4554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975841
83	NC_016839	TGG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975841
84	NC_016839	GAGCTT	2	12	4676	4687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378975841
85	NC_016839	GTA	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975842
86	NC_016839	GCTGA	2	10	4718	4727	20 %	20 %	40 %	20 %	378975842
87	NC_016839	TGA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975842
88	NC_016839	CAAAG	2	10	4882	4891	60 %	0 %	20 %	20 %	378975842
89	NC_016839	GAG	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975842
90	NC_016839	CCT	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378975842
91	NC_016839	ACG	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975842
92	NC_016839	AAG	2	6	4986	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975842
93	NC_016839	GCT	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975842
94	NC_016839	GTCAG	2	10	5102	5111	20 %	20 %	40 %	20 %	378975842
95	NC_016839	AGG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378975842
96	NC_016839	ATG	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975842
97	NC_016839	A	6	6	5363	5368	100 %	0 %	0 %	0 %	378975842
98	NC_016839	TGA	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975842
99	NC_016839	TCA	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975843
100	NC_016839	GTG	2	6	5774	5779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975843
101	NC_016839	TGC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975843
102	NC_016839	TCCA	2	8	5824	5831	25 %	25 %	0 %	50 %	378975843
103	NC_016839	CAT	2	6	5970	5975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975843
104	NC_016839	TGA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975843
105	NC_016839	TAC	2	6	6001	6006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975843
106	NC_016839	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975843
107	NC_016839	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975843
108	NC_016839	GAA	2	6	6189	6194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975843
109	NC_016839	CAG	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975843
110	NC_016839	GAC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975843
111	NC_016839	TGAT	2	8	6335	6342	25 %	50 %	25 %	0 %	378975843
112	NC_016839	CCA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975843
113	NC_016839	TGG	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975843
114	NC_016839	AC	3	6	6404	6409	50 %	0 %	0 %	50 %	378975843
115	NC_016839	CAT	2	6	6420	6425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975843
116	NC_016839	GTT	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975844
117	NC_016839	GCC	2	6	6559	6564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975844
118	NC_016839	GCT	2	6	6715	6720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975844
119	NC_016839	CAA	2	6	6735	6740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975844
120	NC_016839	ACA	2	6	6756	6761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975844
121	NC_016839	GCA	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975844
122	NC_016839	GAA	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378975844
123	NC_016839	TGG	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975844
124	NC_016839	AC	3	6	6908	6913	50 %	0 %	0 %	50 %	378975844
125	NC_016839	CAAA	2	8	6915	6922	75 %	0 %	0 %	25 %	378975844
126	NC_016839	CCA	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975844
127	NC_016839	TGG	2	6	7095	7100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378975844
128	NC_016839	TGT	2	6	7122	7127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378975844
129	NC_016839	CGG	2	6	7290	7295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975844
130	NC_016839	CAT	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975844
131	NC_016839	ATG	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975844
132	NC_016839	CAA	2	6	7351	7356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378975844
133	NC_016839	GAC	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378975844
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253	NC_016839	GGAG	2	8	15146	15153	25 %	0 %	75 %	0 %	378975863
254	NC_016839	TGCTTT	2	12	15172	15183	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	378975863
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256	NC_016839	CGG	2	6	15213	15218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975863
257	NC_016839	ATT	2	6	15260	15265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378975863
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